Name: Un flujo de trabajo computacional bilingüe para identificar posibles inhibidores de PLK1 en la lengua de signos americana y en inglés (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-04-03T15:00:00.000+00:00
Duration: 14 min 34 s
Description: Aprende un flujo de trabajo computacional bilingüe para identificar inhibidores de PLK1 mediante cribado de bases de datos de productos naturales, docking molecular y evaluación ADMET-S. Este método facilita el descubrimiento de fármacos con aplicaciones en oncología.

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<table><tbody><tr><td>ADMETLab3</td><td>Simulations Plus. Inc</td><td>V3.0</td><td>Propiedades de ADMET</td></tr><tr><td>Alphafold</td><td>Busca DeepMind y Busca en Google Isomorphic Labs (filiales de Alphabet)</td><td>V3.0.1</td><td>Modelado de proteínas 3D</td></tr><tr><td>Anaconda/Conda</td><td>Anaconda, Inc.</td><td>V24.9.2</td><td>Sistema de gestión de paquetes de código abierto&nbsp;</td></tr><tr><td>CB-Dock2</td><td>Laboratorio Yang Cao</td><td>V2.0</td><td>Acoplamiento ciego proteína-ligando</td></tr><tr><td>CHARMM-GUI</td><td>Universidad de Lehigh</td><td>V3.8</td><td>Manipulación y simulación biomolecular</td></tr><tr><td>DARWIN sobre ACCESS</td><td>Universidad de Delaware</td><td>N/A</td><td>Computación de alto rendimiento</td></tr><tr><td>ORCA</td><td>FAccTs GmbH</td><td>V6.1.0</td><td>Paquete de química cuántica</td></tr><tr><td>Banco de Datos de Proteínas</td><td>Banco Mundial de Datos de Proteínas</td><td>RRID:SCR_006555</td><td>Base de datos de proteínas</td></tr><tr><td>RDKit</td><td>Código abierto</td><td>RRID:SCR_014274</td><td>Programación quimioinformática</td></tr><tr><td>SuperNatural 3.0</td><td>Instituto de Fisiología y Ciencia-IT (Berlín)</td><td>V3.0</td><td>Biblioteca de moléculas naturales</td></tr><tr><td>SwissADME</td><td>Instituto Suizo de Bioinformática</td><td>RRID:SCR_017865</td><td>Propiedades de ADME</td></tr><tr><td>Toxtree</td><td>Ideaconsult Ltd</td><td>V3.1.0</td><td>Clasificación de toxicidad</td></tr></tbody></table>

un flujo de trabajo computacional bilingüe para identificar posibles inhibidores de plk1 en la lengua de signos americana y en inglés

A Bilingual Computational Workflow for Identifying Potential PLK1 Inhibitors in American Sign Language and English

Un flujo de trabajo computacional bilingüe para identificar posibles inhibidores de PLK1 en la lengua de signos americana y en inglés

Polo-like Kinase 1 (PLK1) plays essential roles in the S, G2, and M phases of the cell cycle, and its overexpression is frequently observed in multiple ...

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Research

JoVE Journal

Chemistry

Aquí se muestra cómo utilizar la ligadura de ensayo de proximidad (PLA), con una combinación de anticuerpos para visualizar la proteína morfogenética ósea (BMP) de señalización en células fijadas. Esta técnica nos permitió seguir la acumulación nuclear de endógeno BMP activa de efectos complejos y cuantificar sus niveles en el tiempo en BMP4 estimulación.

La detección de señalización de Efectos Complejos de aguas abajo de BMP4 uso In situ PLA, un ensayo de la ligadura de proximidad

Aquí se utiliza una biblioteca LentiPlex humano común y tradicionales métodos de secuenciación de genes para identificar los objetivos de promover la supervivencia celular. Demostramos cómo configurar y deconvolute una pantalla LentiPlex y validar los resultados.

LentiPlex MISIÓN combinados de detección del shRNA biblioteca en células de mamífero

El control de la síntesis de proteínas ocurre principalmente en la etapa de iniciación de la traducción, cuyas deficiencias están relacionadas con diversos trastornos. Para comprender mejor su etiología, describimos aquí un protocolo utilizando ovocitos de Xenopus laevis que evalúa la traducción de la transcripción mos en presencia de un mutante del factor de iniciación de la traducción eIF4G1.

Xenopus laevis como modelo para identificar Traducción Deterioro

Resistencia a los medicamentos para terapias dirigidas es generalizada y la necesidad de identificar mecanismos de resistencia - antes o después de la aparición clínica - es fundamental para guiar las estrategias de gestión clínica alternativas. A continuación, presentamos un protocolo para acoplar derivación de líneas resistentes a los fármacos in vitro con la secuenciación para acelerar el descubrimiento de estos mecanismos.

Implementación de<em&gt; In Vitro</em&gt; Droga Resistencia Ensayos: Maximizar el Potencial de Descubrimiento clínicamente relevantes mecanismos de resistencia

Aquí, se presenta un protocolo para el análisis de mediano a alto rendimiento eventos de fosforilación de proteínas a nivel celular. Citometría de flujo de fosfo es un enfoque potente para caracterizar las aberraciones señalización, identificar y validar biomarcadores y Evaluación farmacodinámica.

Citometría de flujo fosfo con códigos de barra fluorescente de la célula para célula de señalización análisis y descubrimiento de biomarcadores

Aquí, presentamos un protocolo eCLIP para determinar los principales objetivos de ARN de los candidatos a RBP en Testis.

Método de inmunoprecipitación de reticulado mejorado (eCLIP) para la identificación eficiente de ARN ligado a proteínas en Testis del ratón

Se presenta un protocolo detallado para la generación de microarrays de proteínas humanas autoensamblados para el cribado de inhibidores de la quinasa.

Detección de inhibidores de la quinasa en microarrays de proteínas humanas autoensamblados

Este estudio tenía como objetivo presentar una estrategia para identificar las interacciones entre fármacos y péptidos. La estrategia consiste en la biopanning de péptidos cortos que reconocen fármacos basados en un biosensor de micropeso de cristal de cuarzo (QCM), seguido de análisis bioinformática para evaluar cuantitativamente la información obtenida para el reconocimiento de fármacos y la anotación de los sitios de unión a fármacos sobre proteínas.

Estrategia de análisis bioaformático y bioinformática basada en biosensores para la validación global de interacciones entre fármacos y proteínas

Hemos desarrollado un enfoque de oncogenómica comparativa entre especies que utiliza análisis genómicos y cribados genómicos funcionales para identificar y comparar dianas terapéuticas en tumores que surgen en modelos de ratón modificados genéticamente y el tipo de tumor humano correspondiente.

Perfiles genéticos y cribado de abandono a escala genómica para identificar dianas terapéuticas en modelos murinos de tumor maligno de la vaina de los nervios periféricos

Untargeted metabolómica ofrece una hipótesis de generación instantánea de un perfil metabólico. Este protocolo se demostrará la extracción y el análisis de los metabolitos de las células, suero, o tejidos. Una gama de metabolitos se examinó utilizando extracción en fase líquido-líquido, microflujo UltraPerformance cromatografía líquida / de alta resolución de la espectrometría de masas (UPLC-HRMS) acoplado al software de análisis diferencial.

Metabolómica no focalizados de fuentes biológicas Uso UltraPerformance cromatografía líquida-espectrometría de masas de alta resolución (UPLC-HRMS)

Aprende un flujo de trabajo computacional bilingüe para identificar inhibidores de PLK1 mediante cribado de bases de datos de productos naturales, docking molecular y evaluación ADMET-S. Este método facilita el descubrimiento de fármacos con aplicaciones en oncología.

Un flujo de trabajo computacional bilingüe para identificar posibles inhibidores de PLK1 en la lengua de signos americana y en inglés (Video) | JoVE Journal

Un flujo de trabajo computacional bilingüe para identificar posibles inhibidores de PLK1 en la lengua de signos americana y en inglés

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