Name: תהליך חישובי דו-לשוני לזיהוי מעכבי PLK1 פוטנציאליים בשפת הסימנים והאנגלית האמריקאית (וידאו) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-04-03T15:00:00.000+00:00
Duration: 14 min 34 s
Description: חקור זרימת עבודה חישובית דו-לשונית לזיהוי מעכבי PLK1 פוטנציאליים. השיטה משלבת docking מולקולרי, חישובי אנרגיית קישור וניתוח ADMET-S לגילוי תרופות.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<table><tbody><tr><td>ADMETLab3</td><td>סימולציות פלוס. בע"מ</td><td>V3.0</td><td>תכונות ADMET</td></tr><tr><td>אלפאפולד</td><td>חפש בגוגל DeepMind & מעבדות איזומורפיות (חברות בת של אלפבית)</td><td>V3.0.1</td><td>מידול חלבונים תלת-ממדיים</td></tr><tr><td>אנקונדה/קונדה</td><td>אנקונדה, בע"מ.</td><td>V24.9.2</td><td>מערכת ניהול חבילות בקוד פתוח&nbsp;</td></tr><tr><td>CB-Dock2</td><td>מעבדת יאנג צאו</td><td>V2.0</td><td>עגינה עיוורת בין חלבון-ליגנד</td></tr><tr><td>צ'ארם-גוי</td><td>אוניברסיטת ליהיי</td><td>V3.8</td><td>מניפולציה ביומולקולרית וסימולציה</td></tr><tr><td>דרווין בגישה</td><td>אוניברסיטת דלאוור</td><td>לא זמין</td><td>מחשוב ביצועים גבוהים</td></tr><tr><td>ORCA</td><td>FAccTs GmbH</td><td>V6.1.0</td><td>חבילת כימיה קוונטית</td></tr><tr><td>מאגר נתוני חלבון</td><td>מאגר נתוני חלבונים עולמי</td><td>RRID:SCR_006555</td><td>מאגר חלבונים</td></tr><tr><td>RDKit</td><td>קוד פתוח</td><td>RRID:SCR_014274</td><td>תכנים כימינפורמטיים</td></tr><tr><td>Supernatural 3.0</td><td>המכון לפיזיולוגיה ומדע-IT (ברלין)</td><td>V3.0</td><td>ספריית מולקולות טבעיות</td></tr><tr><td>SwissADME</td><td>המכון השווייצרי לביואינפורמטיקה</td><td>RRID:SCR_017865</td><td>תכונות ADME</td></tr><tr><td>טוקסטרי</td><td>אידאקונסט' בע"מ</td><td>V3.1.0</td><td>סיווג רעילות</td></tr></tbody></table>

תהליך חישובי דו-לשוני לזיהוי מעכבי plk1 פוטנציאליים בשפת הסימנים והאנגלית האמריקאית

A Bilingual Computational Workflow for Identifying Potential PLK1 Inhibitors in American Sign Language and English

תהליך חישובי דו-לשוני לזיהוי מעכבי PLK1 פוטנציאליים בשפת הסימנים והאנגלית האמריקאית

Polo-like Kinase 1 (PLK1) plays essential roles in the S, G2, and M phases of the cell cycle, and its overexpression is frequently observed in multiple ...

a-bilingual-computational-workflow-for-identifying-potential-plk1

Research

JoVE Journal

Chemistry

כאן אנו מראים כיצד להשתמש קשירת הסמיכות Assay (PLA), עם שילוב של נוגדנים לדמיין המוךפו"גנטי שהולך עצם חלבון (BMP) איתות תאים קבוע. טכניקה זו אפשרה לנו לעקוב אחר הצטברות הגרעין של BMP אנדוגני מופעל מפעיל, מתחמי ולכמת רמות שלהם לאורך זמן תחת גירוי BMP4.

איתור של מפעיל איתות, מתחמי Downstream של BMP4 שימוש באתרו PLA, Assay קשירת הסמיכות

כאן אנו להשתמש בספריית LentiPlex האנושי ונקווה המסורתית רצף שיטות לזיהוי מטרות הגן לקידום הישרדות התא. אנו מדגימים כיצד להגדיר deconvolute מסך LentiPlex ולאמת את התוצאות.

LentiPlex המשימה משולב הקרנת shRNA ספריית בתאי יונקים

בקרת סינתזת חלבונים מתרחשת בעיקר בשלב התחלת התרגום, ליקויים בו קשורים להפרעות מגוונות. כדי להבין טוב יותר את האטיולוגיה שלהם, תיארנו כאן פרוטוקול המשתמש בביציות Xenopus laevis המעריך את התרגום של תעתיק mos בנוכחות מוטציה של גורם התחלת התרגום eIF4G1.

Xenopus laevis כמודל לזיהוי תרגום ירידת ערך

עמידות לתרופות לטיפולים ממוקדים היא נרחבת והצורך לזהות מנגנונים של התנגדות - לפני או אחרי הופעה קלינית - היא קריטי להדרכת אסטרטגיות ניהול קליניות חלופיות. כאן, אנו מציגים פרוטוקול לגזירה כמה קווים עמידים לתרופות במבחנה עם רצף לזרז גילוי המנגנונים אלה.

הטמעה של<em&gt; במבחנה</em&gt; תרופות מבחני התנגדות: למקסם את הפוטנציאל לחשיפת מנגנוני התנגדות קלינית רלוונטיים

כאן מוצג פרוטוקול לניתוח בינוני - כדי תפוקה גבוהה של חלבון זרחון אירועים ברמה התאית. Cytometry זרימה פוספו היא גישה רב-עוצמה כדי לאפיין את סטיות איתות, לזהות, לאמת סמנים ביולוגיים, ולהעריך pharmacodynamics.

Cytometry זרימה פוספו עם פלורסנט תא Barcoding עבור תא בודד איתות ניתוח וגילוי סמן

כאן, אנו מציגים פרוטוקול eCLIP כדי לקבוע מטרות של RNA הגדולות של מועמדים RBP בתוך בנות.

משופרת Crosslinking Immunoprecipitation (eCLIP) שיטה לזיהוי יעיל של רנ א חלבון מאוגד ב העכבר בתוך הראש

פרוטוקול מפורט ליצירת מיקרומערכים של חלבון אנושי מורכב באמצעות הקרנת מעכבי הסרט מוצג.

הקרנת מעכבי קינאז במיקרוערכים של חלבון אנושי מורכב בעצמו

מחקר זה נועד להציג אסטרטגיה לזיהוי אינטראקציות תרופתיות פפטיד. האסטרטגיה כוללת ביופאנינג של פפטידים קצרים לזיהוי תרופות המבוססים על מיקרו-איזון של גביש קוורץ (QCM), ואחריו ניתוח ביואינפורמטיקה להערכת כמותיות של המידע המתקבל להכרה בסמים וביאור של אתרי איגוד התרופות בחלבונים.

ביו-panning מבוסס Biosensor ואסטרטגיית ניתוח ביואינפורמטיקה לאימות גלובלי של אינטראקציות עם חלבונים תרופתיים

פיתחנו גישה אונקוגנומית השוואתית חוצת מינים המשתמשת בניתוחים גנומיים ובמסכים גנומיים פונקציונליים כדי לזהות ולהשוות מטרות טיפוליות בגידולים הנובעים ממודלים של עכברים מהונדסים גנטית וסוג הגידול האנושי המתאים.

פרופיילינג גנטי וסינון נשירה בקנה מידה גנומי לזיהוי מטרות טיפוליות במודלים עכבריים של גידול ממאיר במעטפת עצב היקפית

לא ממוקד metabolomics מספק השערת יצירת תמונת מצב של פרופיל מטבולי. פרוטוקול זה יהיה להדגים את המיצוי והניתוח של מטבוליטים מתאי, סרום, או רקמות. מגוון המטבוליטים סקר באמצעות מיצוי שלב נוזלי נוזלי, microflow ultraperformance כרומטוגרפיה נוזלית / רזולוציה גבוהה ספקטרומטריית מסה (UPLC-HRMS) מצמידים את תוכנת ניתוח ההפרש.

Metabolomics לא ממוקדים ממקורות ביולוגיים באמצעות Ultraperformance כרומטוגרפיה נוזלית-רזולוציה גבוהה ספקטרומטריית מסה (UPLC-HRMS)

חקור זרימת עבודה חישובית דו-לשונית לזיהוי מעכבי PLK1 פוטנציאליים. השיטה משלבת docking מולקולרי, חישובי אנרגיית קישור וניתוח ADMET-S לגילוי תרופות.

תהליך חישובי דו-לשוני לזיהוי מעכבי PLK1 פוטנציאליים בשפת הסימנים והאנגלית האמריקאית

גלה סרטונים נוספים