이 프로토콜은 간질성 폐질환과 폐고혈압을 예시로 사용하며, 서지계량학과 생물정보학을 통합하여 연구 동향, 핫스팟, 주요 표적 및 관련 경로를 체계적이고 예비적으로 탐구합니다. 이 프로토콜은 프롬프트를 수정하여 질병 쌍을 분석하는 데 복제할 수 있습니다.
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이 프로토콜은 간질성 폐질환과 폐고혈압을 예시로 사용하며, 서지계량학과 생물정보학을 통합하여 연구 동향, 핫스팟, 주요 표적 및 관련 경로를 체계적이고 예비적으로 탐구합니다. 이 프로토콜은 프롬프트를 수정하여 질병 쌍을 분석하는 데 복제할 수 있습니다.
간질성 폐질환(ILD)과 폐고혈압(PH)은 종종 동반질환으로 공존하여 임상 결과가 좋지 않고 치료 옵션이 제한적입니다. 중요한 연구 핫스팟을 식별하고 주요 동반 질환 표적을 밝히는 것은 질병 관리 개선과 새로운 치료 전략 개발에 필수적입니다. 이 프로토콜은 Web of Science Core Collection과 Scopus 데이터베이스에서 관련 출판물을 검색하고, CiteSpace와 VOSviewer를 사용해 연구 핫스팟과 변화하는 추세를 지도화합니다. 이후 GeneCards 데이터베이스에서 두 질병과 관련된 중복 유전적 표적이 확인됩니다. 단백질-단백질 상호작용 네트워크는 STRING을 사용하여 허브 유전자를 식별하며, KEGG 경로 풍부 분석을 R 언어를 사용하여 주요 신호 전달 경로를 명확히 합니다. 결과는 서지 측정학이 이 학제간 분야의 발전 경로를 거시적 관점에서 식별한다는 것을 보여줍니다; 생물정보학 분석 결과 FN1, IL6, TNF가 잠재적 핵심 동반 질환 표적임이 밝혀졌으며; KEGG 농축 분석은 PI3K-Akt와 MAPK를 중심으로 한 면역 관련 경로가 동반 질환의 발병에 깊이 관여함을 보여줍니다. 두 접근법을 통합함으로써, 본 프로토콜은 ILD-PH 동반질환 연구의 발달 경로와 연구 핫스팟을 체계적으로 명확히 규정하고, 잠재적 동반질환 표적과 경로를 예비적으로 선별합니다. 이는 향후 실험 연구와 임상 검증을 위한 방향성과 계산적 기반을 제공합니다. 이 통합 프레임워크는 다른 복잡한 질병 동반 질환 연구에 적용 가능한 재현 가능한 방법론을 제공합니다.
간질성 폐질환(ILD)은 폐간질의 염증과 섬유화로 병리학적으로 특징지어지는 확산성 폐 질환군을 의미합니다. 질병 진행 과정에서 여러 동반 질환으로 복잡해지는 경우가 많으며, 그중 폐고혈압(PH)은 예후에 큰 영향을 미치는 흔한 동반질환 중 하나입니다 1,2. 역학 자료에 따르면 ILD 환자의 PH 발생률은 아형과 질환 단계에 따라 13%에서 86% 사이로 다양합니다. 이 동반 질환은 환자의 삶의 질을 크게 저하시키고 사망 위험을 높일 뿐만 아니라, 사회경제적·의료 부담을 악화시킵니다 6,7. 폐동맥 고혈압과 달리, 간질성 폐질환 관련 폐고혈압의 병인기는 더 복잡하며, 저산소성 폐혈관 수축, 섬유화 및 염증성 인자 매개 혈관 재형성, 세포외 기질 침착 등 여러 병리학적 과정을 포함합니다 8,9,10. 현재 이 동반 질환에 대한 임상 진단과 치료 전략은 비교적 제한적이며, 특정 표적 약물도 부족합니다. 그 기저 분자 기전, 주요 신호 전달 경로, 초기 바이오마커는 아직 체계적으로 밝혀지지 않아야 합니다11,12.
연구 중심점과 진화 경로를 감지하는 객관적 도구로서 서지계량학은 최근 몇 년간 광범위하게 적용되고 있습니다13,14. 생물정보학 분석은 이전에 발견된 질병 관련 표적을 통합하여 주요 표적과 핵심 경로를 식별합니다15. 동반질환 연구에서는 거시적 연구 핫스팟과 분자 수준의 경로 및 표적 정보를 통합함으로써 동반 질환 메커니즘에 대한 이해를 심화시키고, 이후 실험 연구에 대한 계산적 예측과 방향성 지침을 제공합니다. 그러나 간질성 폐질환과 폐고혈압의 동반 질환에 관한 연구는 여전히 거시적 지식 매핑과 미시적 분자 네트워크를 결합한 체계적 통합 분석이 부족하다. 이에 따라 본 연구는 Web of Science Core Collection(WoSCC)과 Scopus 데이터베이스를 활용하여 ILD-PH 공존 질환 연구의 발전 경로와 연구 핫스팟을 서지계량학 방법을 통해 포괄적으로 개괄하였습니다. 동시에 생물정보학 도구를 활용해 핵심 유전자와 동반 질환과 관련된 잠재적 분자 경로를 식별하여, 이후 실험 연구와 목표 탐사를 위한 분자 기반과 실험 설계 방향을 제공하였습니다.
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이 연구는 GeneCards, STRING, KEGG 등 공개된 2차 데이터베이스를 사용했습니다. 중국 인간유전자원 규정 제32조에 따르면, 이 데이터베이스들은 중국 내에서 직접 인간 유전자원을 수집하는 것을 포함하지 않습니다; 따라서 이 연구에는 윤리적 승인이나 사전 동의가 필요하지 않았습니다. 이 섹션에서 사용되는 소프트웨어 및 플랫폼의 상세 버전 정보는 재료표에 제공되어 있습니다.
1. 문헌 수집 및 조직
2. 연간 출판물 산출 추세 분석
3. 국가/지역 출판물 결과 및 국제 협력 분석
4. 학술지 출판 결과 및 인용 분석
5. 고생산성 저자 협업 네트워크 분석
6. 키워드 동시 발생과 주제 진화 분석
7. 참고문헌 공동 인용 분석
8. PPI 네트워크 분석
9. KEGG 경로 농축 분석
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데이터 검색 및 스크리닝
총 2,400건의 기록이 Scopus 데이터베이스에서 수집되었고, 696건은 WoSCC 데이터베이스에서 확인되었습니다. 두 데이터셋을 통합하고 533개의 중복 기록을 제거한 후, 총 2,563건의 고유 출판물이 후속 서지 분석을 위해 포함되었습니다(그림 1).
연간 출판 결과 추세
2016년부터 2025년까지 간질성 폐질환 및 폐고혈압 분야의 연간 출판물 생산량은 그림 2에 나타난다. 10년 동안 출판물 수는 변동하는 증가 추세를 보였습니다. 첫 4년간은 비교적 안정적이었으나, 2020–2022년과 2023–2025년에 급격히 상승...
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이 연구는 ILD와 PH의 동반 질환을 탐구하기 위해 서지계량학과 생물정보학을 통합적으로 적용한 최초의 사례입니다. 지난 10년간 이 분야의 발달 경로, 지식 구조, 최첨단 동향을 체계적으로 검토하고, 이 공존 상태를 분자 수준에서 기저화하는 허브 유전자와 주요 신호 전달 경로를 규명합니다. 거시적 추세 관점에서 볼 때, 이 분야의 연간 논문 수는 2016년 142편에서 2025년 402편으로 증가했으며, 이는 ILD-PH 동반 질환에 대한 학문적 관심이 지속적으로 증가한 것을 반영합니다. 2020년부터 2022년, 2023년부터 2025년까지 두 시기에 상당한 급증이 관찰되었습니다. 2020년경의 성장 전환점은 COVID-19 팬데믹과 겹쳤으며; 팬데믹이 ILD와 pH를 유발하거나 악화시켜 간접적으로 관련 연구의 급증을 촉진했을 가능성도 있습니다. 2022년부터 2023년까지의 정점은 PH-ILD 치료 방법의 탐구, 검증 및 예비 임상 적용이 증가한 데 기인할 수 있...
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저자들은 이 연구에서 이해 상충이 없다고 보고했습니다.
저자들은 비전염성 만성 질환-국가 과학기술주 프로젝트(2024ZD0522300, 2024ZD0522301)와 중국의학과학원 비영리 중앙연구소기금(2022-ZHCH330-01)의 재정 지원에 감사드립니다.
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| 이름 | 회사 | 카탈로그 번호 | 댓글 |
|---|---|---|---|
| Bibliometric Online Analysis Platform | K-Synth Srl (Bibliometric) | https://bibliometric.com | 온라인 분석 플랫폼; 모듈: 국가 관계; 국가 협력 코드 다이어그램 생성; 2026년 3월 10일 접근 |
| CiteSpace | Drexel University | 6.4.R1 | 비블리오메트릭 분석; 시간 슬라이싱: 2016–2025; 노드 유형: 키워드, 참조; 가지치기: Pathfinder + Pruning sliced networks |
| clusterProfiler (R 패키지) | Guangchuang Yu et al. | 4.13.2 | KEGG 강화 분석; 임계값: p < 0.05, q < 0.2 |
| Cytoscape | Cytoscape Consortium | 3.10.3 | 네트워크 시각화 및 분석; 플러그인: CytoHubba; 알고리즘: 정도 중심성; 허브 유전자 식별에 사용 |
| GeneCards | Weizmann Institute of Science | https://www.genecards.org | 유전자 정보 데이터베이스; 데이터베이스 버전 5.22; 2026년 3월 12일 접근; 필터링 기준: 관련성 점수 ≥ 1 |
| Journal Citation Reports (JCR) | Clarivate Analytics | https://jcr.clarivate.com | 저널 임팩트 팩터 및 사분면 검색; 2026년 3월 9일 접근 |
| KEGG | Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes | https://www.kegg.jp | 경로 데이터베이스; 2026년 3월 13일 클러스터프로파일러 API를 통해 접근; 종: hsa |
| MeSH Database | National Library of Medicine (NLM) | https://meshb.nlm.nih.gov | MeSH 용어 검색 데이터베이스; 2026년 3월 9일 접근; 검색 전략 구성에 사용 |
| Microsoft Excel | Microsoft Corporation | 16.88 (Microsoft 365) | 데이터 통계 및 차트 생성; 간행물 카운트, 중복 제거, 차트 플로팅에 사용 |
| org.Hs.eg.db (R 패키지) | Bioconductor Core Team | 3.20.0 | 인간 게놈 주석 데이터베이스; 유전자 ID 변환에 사용 |
| R | R Core Team | 4.4.2 | 통계 컴퓨팅 및 플로팅 환경; 실행 날짜: 2026년 3월 13일 |
| Scimago Graphica | Scimago Lab | 2 | 시각화 도구; 레이아웃: 지도 투영; 에지 곡률: 0.5; 색상 매핑: 클러스터별 |
| Scopus | Elsevier | https://www.scopus.com | 문헌 검색 데이터베이스; Elsevier Scopus 2026 완전판; 검색 날짜: 2026년 3월 9일 |
| STRING | EMBL | 12.0 / https://cn.string-db.org | 단백질-단백질 상호작용 데이터베이스; 2026년 3월 12일 접근; 상호작용 점수 임계값: 0.7 (높은 신뢰도); 네트워크 유형: 물리적 + 기능적 |
| VOSviewer | Leiden University | 1.6.20 | 비블리오메트릭 분석; 공동 저자로 분석 유형; 정규화 방법: 연관 강도 |
| Web of Science Core Collection | Clarivate Analytics | https://www.webofscience.com | 문헌 검색 데이터베이스; SCIE 및 SSCI 서브 데이터베이스 포함; 검색 날짜: 2026년 3월 9일 |
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