Name: Um Fluxo de Trabalho Computacional Bilíngue para Identificar Potenciais Inibidores de PLK1 na Língua de Sinais Americana e no Inglês (Vídeo) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-04-03T15:00:00.000+00:00
Duration: 14 min 34 s
Description: Descubra um fluxo de trabalho computacional bilíngue para identificar inibidores de PLK1 usando docking molecular e avaliação ADMET-S. Este método auxilia pesquisadores na descoberta de fármacos contra câncer.

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<table><tbody><tr><td>ADMETLab3</td><td>Simulations Plus. Inc</td><td>V3.0</td><td>Propriedades ADMET</td></tr><tr><td>Alphafold</td><td>Pesquise DeepMind & Isomorphic Labs (subsidiárias da Alphabet)</td><td>V3.0.1</td><td>Modelagem de proteínas 3D</td></tr><tr><td>Anaconda/Conda</td><td>Anaconda, Inc.</td><td>V24.9.2</td><td>Sistema de gerenciamento de pacotes open source &nbsp;</td></tr><tr><td>CB-Dock2</td><td>Laboratório Yang Cao</td><td>V2.0</td><td>Acoplamento cego proteína-ligante</td></tr><tr><td>CHARMM-GUI</td><td>Universidade Lehigh</td><td>V3.8</td><td>Manipulação e simulação biomolecular</td></tr><tr><td>DARWIN no ACCESS</td><td>Universidade de Delaware</td><td>N/A</td><td>Computação de alto desempenho</td></tr><tr><td>ORCA</td><td>FAccTs GmbH</td><td>V6.1.0</td><td>Pacote de química quântica</td></tr><tr><td>Banco de Dados de Proteínas</td><td>Banco Mundial de Dados de Proteínas</td><td>RRID:SCR_006555</td><td>Banco de dados de proteínas</td></tr><tr><td>RDKit</td><td>Código aberto</td><td>RRID:SCR_014274</td><td>Programação em quimioinformática</td></tr><tr><td>SuperNatural 3.0</td><td>Instituto de Fisiologia e Ciência-TI (Berlim)</td><td>V3.0</td><td>Biblioteca de moléculas naturais</td></tr><tr><td>SwissADME</td><td>Instituto Suíço de Bioinformática</td><td>RRID:SCR_017865</td><td>Propriedades do ADME</td></tr><tr><td>Toxtree</td><td>Ideaconsult Ltd</td><td>V3.1.0</td><td>Classificação de toxicidade</td></tr></tbody></table>

um fluxo de trabalho computacional bilíngue para identificar potenciais inibidores de plk1 na língua de sinais americana e no inglês

A Bilingual Computational Workflow for Identifying Potential PLK1 Inhibitors in American Sign Language and English

Um Fluxo de Trabalho Computacional Bilíngue para Identificar Potenciais Inibidores de PLK1 na Língua de Sinais Americana e no Inglês

Polo-like Kinase 1 (PLK1) plays essential roles in the S, G2, and M phases of the cell cycle, and its overexpression is frequently observed in multiple ...

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Research

JoVE Journal

Chemistry

Aqui nós mostramos como usar Assay Proximidade Ligadura (PLA), com uma combinação de anticorpos para visualizar proteínas morfogenéticas ósseas (BMP) de sinalização em células fixas. Esta técnica permitiu-nos a seguir o acúmulo nuclear de BMP activada endógena efetoras complexos e quantificar os seus níveis ao longo do tempo sob BMP4 estimulação.

Detecção de Sinalização de Efeitos Complexos Downstream de BMP4 Usando In situ PLA, um Ensaio Ligadura Proximidade

Aqui usamos uma biblioteca LentiPlex humanos agrupados e tradicionais métodos de seqüenciamento de genes para identificar alvos promover a sobrevivência celular. Demonstramos como configurar e deconvolute uma tela LentiPlex e validar os resultados.

LentiPlex MISSÃO Pooled shRNA Screening Biblioteca em células de mamíferos

O controle da síntese proteica ocorre principalmente na etapa de iniciação da tradução, cujas deficiências estão ligadas a diversos distúrbios. Para melhor entender sua etiologia, descrevemos aqui um protocolo usando oócitos de Xenopus laevis avaliando a tradução do transcrito mos na presença de um mutante do fator de iniciação da tradução eIF4G1.

Xenopus laevis como um modelo para identificar Tradução Impairment

A resistência aos medicamentos para a terapêutica visados ​​é generalizada e à necessidade de identificar mecanismos de resistência - antes ou após o início clínico - é fundamental para orientar estratégias de gestão de clínicas alternativas. Aqui, apresentamos um protocolo para casal derivação de linhas resistentes a drogas in vitro com sequenciamento para agilizar a descoberta desses mecanismos.

Implementação de<em&gt; In Vitro</em&gt; Droga de Resistência Ensaios: maximizar o potencial para Descobrindo clinicamente relevantes mecanismos de resistência

Aqui, apresenta-se um protocolo para análise de médio - a elevado-produção de eventos de fosforilação de proteínas no nível celular. Phospho citometria de fluxo é uma poderosa abordagem para caracterizar as aberrações de sinalização, identificar e validar biomarcadores e avaliar farmacodinâmica.

Citometria de fluxo phospho com Barcoding fluorescente de célula para célula única sinalização análise e descoberta de Biomarker

Aqui, nós apresentamos um protocolo de eCLIP para determinar alvos principais do RNA de candidatos do RBP no testis.

Método avançado da imunoprecipitação da reticulação (eCLIP) para a identificação eficiente do RNA proteína-ligado no testis do rato

Um protocolo detalhado para a geração de Microarrays humanos Self-assembled da proteína para a seleção de inibidores da quinase é apresentado.

Triagem de inibidores da quinase em Microarrays de proteínas humanas Automontados

Este estudo teve como objetivo apresentar uma estratégia para identificar interações medicamentosa-peptídeos. A estratégia envolve o biopanning de peptídeos curtos que reconhecem drogas com base em um biosensor de microequilísã de quartzo-cristal (QCM), seguido de análise bioinformática para avaliação quantitativa das informações obtidas para o reconhecimento de medicamentos e anotação dos locais de ligação medicamentosa em proteínas.

Estratégia de análise de biopanning e bioinformática baseada em biosensor para a validação global de interações medicamentosas-proteínas

Desenvolvemos uma abordagem oncogenômica comparativa entre espécies utilizando análises genômicas e telas genômicas funcionais para identificar e comparar alvos terapêuticos em tumores surgidos em modelos de camundongos geneticamente modificados e o tipo de tumor humano correspondente.

Perfil Genético e Triagem de Abandono em Escala Genômica para Identificar Alvos Terapêuticos em Modelos Murinos de Tumor Maligno de Bainha de Nervo Periférico

Irrelevantes metabolômica fornece uma hipótese gerando instantâneo de um perfil metabólico. Este protocolo irá demonstrar a extracção e análise de metabolitos a partir de células, soro ou tecido. Uma gama de metabolitos são pesquisadas utilizando extracção de fase líquido-líquido, cromatografia líquida de microfluxo UltraPerformance /-espectrometria de massa de alta resolução (UPLC-HRMS), acoplado ao software de análise diferencial.

Metabolomics irrelevantes de fontes biológicas Usando UltraPerformance cromatografia líquida de alta resolução Espectrometria de Massa (UPLC-HRMS)

Descubra um fluxo de trabalho computacional bilíngue para identificar inibidores de PLK1 usando docking molecular e avaliação ADMET-S. Este método auxilia pesquisadores na descoberta de fármacos contra câncer.

Um Fluxo de Trabalho Computacional Bilíngue para Identificar Potenciais Inibidores de PLK1 na Língua de Sinais Americana e no Inglês (Vídeo) | JoVE Journal

Um Fluxo de Trabalho Computacional Bilíngue para Identificar Potenciais Inibidores de PLK1 na Língua de Sinais Americana e no Inglês

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