Name: Phytophthora palmivoranın Agrobakteri Aracılı Dönüşümü İçin Basitleştirilmiş Bir Yöntem (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2026-03-20T13:15:00.000+00:00
Duration: 6 min 38 s
Description: Öğrenin, Phytophthora palmivora ve P. capsici için Agrobacterium aracılı genetik dönüşüm protokolünü. Bu basit ve tekrarlanabilir yöntem, bitki patojenlerinde gen fonksiyonlarını incelemek için değerli bir araçtır.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

<ol><li>Kamoun, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+top+10+oomycete+pathogens+in+molecular+plant+pathology%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Pathol%22%5BJournal%5D)">The top 10 oomycete pathogens in molecular plant pathology.</a> Mol Plant Pathol. 16 (4), 413-434 (2015).</li>
<li>Jones, J. D., Staskawicz, B. J., Dangl, J. L. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+plant+immune+system%3A+From+discovery+to+deployment%5BTitle%5D)+AND+%22Cell%22%5BJournal%5D)">The plant immune system: From discovery to deployment.</a> Cell. 187 (9), 2095-2116 (2024).</li>
<li>Tocafundo, F., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Direct+and+cross-pathogenicity+of+Phytophthora+palmivora+against+cacao%2C+papaya%2C+and+peach+palm%5BTitle%5D)+AND+%22Trop+Plant+Pathol%22%5BJournal%5D)">Direct and cross-pathogenicity of Phytophthora palmivora against cacao, papaya, and peach palm.</a> Trop Plant Pathol. 46 (6), 664-673 (2021).</li>
<li>Morales-Cruz, A., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Independent+whole-genome+duplications+define+the+architecture+of+the+genomes+of+the+devastating+West+African+cacao+black+pod+pathogen+Phytophthora+megakarya+and+its+close+relative+Phytophthora+palmivora%5BTitle%5D)+AND+%22G3+%28Bethesda%29%22%5BJournal%5D)">Independent whole-genome duplications define the architecture of the genomes of the devastating West African cacao black pod pathogen Phytophthora megakarya and its close relative Phytophthora palmivora.</a> G3 (Bethesda). 10 (7), 2241-2255 (2020).</li>
<li>Ali, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((PCR-based+identification+of+cacao+black+pod+causal+agents+and+identification+of+biological+factors+possibly+contributing+to+Phytophthora+megakarya%27s+field+dominance+in+West+Africa%5BTitle%5D)+AND+%22Plant+Pathol%22%5BJournal%5D)">PCR-based identification of cacao black pod causal agents and identification of biological factors possibly contributing to Phytophthora megakarya's field dominance in West Africa.</a> Plant Pathol. 65 (7), 1095-1108 (2016).</li>
<li>Marelli, J. -P., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Chocolate+under+threat+from+old+and+new+cacao+diseases%5BTitle%5D)+AND+%22Phytopathology%22%5BJournal%5D)">Chocolate under threat from old and new cacao diseases.</a> Phytopathology. 109 (8), 1331-1343 (2019).</li>
<li>Cvitanich, C., Judelson, H. S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Stable+transformation+of+the+oomycete%2C+Phytophthora+infestans%2C+using+microprojectile+bombardment%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Genet%22%5BJournal%5D)">Stable transformation of the oomycete, Phytophthora infestans, using microprojectile bombardment.</a> Curr Genet. 42 (4), 228-235 (2003).</li>
<li>Judelson, H. S., Tyler, B. M., Michelmore, R. W. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Transformation+of+the+oomycete+pathogen%2C+Phytophthora+infestans%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">Transformation of the oomycete pathogen, Phytophthora infestans.</a> Mol Plant Microbe Interact. 4 (6), 602-607 (1991).</li>
<li>Wang, W., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((an+oxathiapiprolin-resistance+gene%2C+functions+as+a+novel+selection+marker+for+Phytophthora+transformation+and+CRISPR%2FCas9+mediated+genome+editing%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">an oxathiapiprolin-resistance gene, functions as a novel selection marker for Phytophthora transformation and CRISPR/Cas9 mediated genome editing.</a> Front Microbiol. 10, 2402(2019).</li>
<li>Dai, T., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((An+improved+transformation+system+for+Phytophthora+cinnamomi+using+green+fluorescent+protein%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Microbiol%22%5BJournal%5D)">An improved transformation system for Phytophthora cinnamomi using green fluorescent protein.</a> Front Microbiol. 12, 682754(2021).</li>
<li>Fang, Y., Cui, L., Gu, B., Arredondo, F., Tyler, B. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Efficient+genome+editing+in+the+oomycete+Phytophthora+sojae+using+CRISPR%2FCas9%5BTitle%5D)+AND+%22Curr+Protoc+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Efficient genome editing in the oomycete Phytophthora sojae using CRISPR/Cas9.</a> Curr Protoc Microbiol. 44 (1), 21A.1.1-21A.1.26 (2017).</li>
<li>Evangelisti, E., Yunusov, T., Shenhav, L., Schornack, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((N-acetyltransferase+AAC+%283%29-i+confers+gentamicin+resistance+to+Phytophthora+palmivora+and+Phytophthora+infestans%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">N-acetyltransferase AAC (3)-i confers gentamicin resistance to Phytophthora palmivora and Phytophthora infestans.</a> BMC Microbiol. 19 (1), 265(2019).</li>
<li>Dong, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Establishment+of+the+straightforward+electro-transformation+system+for+Phytophthora+infestans+and+its+comparison+with+the+improved+PEG%2FCaCl2+transformation%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microbiol+Methods%22%5BJournal%5D)">Establishment of the straightforward electro-transformation system for Phytophthora infestans and its comparison with the improved PEG/CaCl2 transformation.</a> J Microbiol Methods. 112, 83-86 (2015).</li>
<li>Huitema, E., Smoker, M., Kamoun, S. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+straightforward+protocol+for+electro-transformation+of+Phytophthora+capsici+zoospores%5BTitle%5D)+AND+%22Methods+Mol+Biol%22%5BJournal%5D)">A straightforward protocol for electro-transformation of Phytophthora capsici zoospores.</a> Methods Mol Biol. 712, 129-135 (2011).</li>
<li>Vijn, I., Govers, F. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Agrobacterium+tumefaciens+mediated+transformation+of+the+oomycete+plant+pathogen+Phytophthora+infestans%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Pathol%22%5BJournal%5D)">Agrobacterium tumefaciens mediated transformation of the oomycete plant pathogen Phytophthora infestans.</a> Mol Plant Pathol. 4 (6), 459-467 (2003).</li>
<li>Wu, D., Navet, N., Liu, Y., Uchida, J., Tian, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Establishment+of+a+simple+and+efficient+Agrobacterium-mediated+transformation+system+for+Phytophthora+palmivora%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Establishment of a simple and efficient Agrobacterium-mediated transformation system for Phytophthora palmivora.</a> BMC Microbiol. 16 (1), 204(2016).</li>
<li>Gumtow, R., Wu, D., Uchida, J., Tian, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+Phytophthora+palmivora+extracellular+cystatin-like+protease+inhibitor+targets+papain+to+contribute+to+virulence+on+papaya%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Plant+Microbe+Interact%22%5BJournal%5D)">A Phytophthora palmivora extracellular cystatin-like protease inhibitor targets papain to contribute to virulence on papaya.</a> Mol Plant Microbe Interact. 31 (3), 363-373 (2018).</li>
<li>Pettongkhao, S., Navet, N., Schornack, S., Tian, M., Churngchow, N. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+secreted+protein+of+15+kDa+plays+an+important+role+in+Phytophthora+palmivora+development+and+pathogenicity%5BTitle%5D)+AND+%22Sci+Rep%22%5BJournal%5D)">A secreted protein of 15 kDa plays an important role in Phytophthora palmivora development and pathogenicity.</a> Sci Rep. 10 (1), 2319(2020).</li>
<li>Minz, A., Sharon, A. Electroporation and Agrobacterium-mediated spore transformation. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMinz%2C+A+%22Molecular+and+Cell+Biology+Methods+for+Fungi%22">Molecular and Cell Biology Methods for Fungi</a>. Sharon, A. , Humana Press. Totowa, NJ. 21-32 (2010).</li>
<li>Bellemain, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((ITS+as+an+environmental+DNA+barcode+for+fungi%3A+An+in+silico+approach+reveals+potential+PCR+biases%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">ITS as an environmental DNA barcode for fungi: An in silico approach reveals potential PCR biases.</a> BMC Microbiol. 10 (1), 189(2010).</li>
<li>Wang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((A+modified+Agrobacterium-mediated+transformation+for+two+oomycete+pathogens%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+Pathog%22%5BJournal%5D)">A modified Agrobacterium-mediated transformation for two oomycete pathogens.</a> PLoS Pathog. 19 (4), e1011346(2023).</li>
<li>Wu, E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimized+Agrobacterium-mediated+sorghum+transformation+protocol+and+molecular+data+of+transgenic+sorghum+plants%5BTitle%5D)+AND+%22In+Vitro+Cell+Dev+Biol+Plant%22%5BJournal%5D)">Optimized Agrobacterium-mediated sorghum transformation protocol and molecular data of transgenic sorghum plants.</a> In Vitro Cell Dev Biol Plant. 50 (1), 9-18 (2014).</li>
<li>Sun, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((TDNAscan%3A+A+software+to+identify+complete+and+truncated+T-DNA+insertions%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Genet%22%5BJournal%5D)">TDNAscan: A software to identify complete and truncated T-DNA insertions.</a> Front Genet. 10, 685(2019).</li>
<li>Navet, N., Tian, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Agrobacterium-mediated+transformation+of+sweet+basil+%28Ocimum+basilicum%29%5BTitle%5D)+AND+%22Bio+Protoc%22%5BJournal%5D)">Agrobacterium-mediated transformation of sweet basil (Ocimum basilicum).</a> Bio Protoc. 10 (22), e3828-e3828 (2020).</li>
<li>Hasley, J., Dinulong, R. -J., Adhikari, A., Christopher, D., Tian, M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Genome+editing+of+papaya+using+both+Cas9+and+Cas12a%5BTitle%5D)+AND+%22bioRxiv%22%5BJournal%5D)">Genome editing of papaya using both Cas9 and Cas12a.</a> bioRxiv. , (2025).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>1.5 mL Mikrosantrifüj Tüpleri</td><td>VWR</td><td>525-1126</td><td></td></tr><tr><td>4'-Hidroksi-3',5' dimetoksiasetofenon</td><td>TCI</td><td>D2666</td><td>Asetosiringon (AS)</td></tr><tr><td>50 mL Tüp</td><td>Greiner Bio-one</td><td>227261</td><td></td></tr><tr><td>Mutlak Etanol</td><td>Fisher Biyoreaktifleri</td><td>BP28184</td><td></td></tr><tr><td>Agar</td><td>Fisher Biyoreaktifleri</td><td>BP1423-500</td><td></td></tr><tr><td>Alüminyum folyo</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Hybond-N+ membranı (30 cm ve 3 m)</td><td>Cytiva</td><td>RPN303B</td><td></td></tr><tr><td>Kalsiyum karbonat</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>239216-500G</td><td>CaCO3</td></tr><tr><td>Sefotaksim sodyum tuzu</td><td>Termobilimsel Kimyasallar</td><td>AAJ6269006</td><td></td></tr><tr><td>D-(+)-Glikoz</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>G8270-1KG</td><td></td></tr><tr><td>DNeasy PowerLyzer Mikrobiyal Kiti</td><td>Qiagen</td><td>12255-50</td><td></td></tr><tr><td>Forseps</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Flüoresans mikroskobu</td><td>Zeiss</td><td></td><td>ZEISS Aksiyoskop 5 floresans mikroskobu filtre seti 38 HE</td></tr><tr><td>G418 sülfat</td><td>Termobilimsel Kimyasallar</td><td>AC329400010</td><td></td></tr><tr><td>Gliserol</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>911046-1L</td><td></td></tr><tr><td>Hemacytometer (Parlak Çizgi)</td><td>Hausser Scientific</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Kanamisin sülfat</td><td>Santa Cruz Biyoteknolojisi</td><td>SC-257635</td><td></td></tr><tr><td>L-Asparagine susuz</td><td>MP Biyomedikal</td><td>ICN10079425</td><td></td></tr><tr><td>LB Broth, Miller</td><td>Fisher Biyoreaktifleri</td><td>BP1426-2</td><td></td></tr><tr><td>Magnezyum sülfat heptahidrat</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>63138-250G</td><td>MgSO4&middot; 7H2O</td></tr><tr><td>MES Hydrate</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>M2933-100G</td><td></td></tr><tr><td>Murashige ve Skoog Bazal Ortamı</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>M5519-50L</td><td></td></tr><tr><td>Petri Kabı (100 mm x 15 mm)</td><td>VWR</td><td>25384-342</td><td></td></tr><tr><td>Potasyum dihidrojen fosfat</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>1370391000</td><td>KH2PO4</td></tr><tr><td>Rifampisin</td><td>Santa Cruz Biyoteknolojisi</td><td>SC-200910</td><td></td></tr><tr><td>Taq 2X Master Mix</td><td>NEB</td><td>M0270L</td><td></td></tr><tr><td>Tiamin hidroklorür</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>T4625-5G</td><td></td></tr><tr><td>UV-Görünür Spektrofotometre</td><td>Fisher Scientific</td><td>14-385-355</td><td></td></tr><tr><td>V8 Orijinal %100 Sebze Suyu</td><td>Campbell Çorba Şirketi</td><td></td><td></td></tr><tr><td>Vortexer</td><td>Fisher Scientific</td><td>14-955-163</td><td></td></tr><tr><td>Su</td><td></td><td></td><td>Moleküler Biyoloji Derecesi, Mill-Q su arıtma sistemi kullanılarak arıtılmış</td></tr><tr><td>Maya Ekstraktı</td><td>ACROS</td><td>611805000</td><td>Şu anda Thermo Scientific Chemicals aracılığıyla mevcut</td></tr><tr><td>&beta;-Sitosterol</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>85451-100G</td><td></td></tr></tbody></table>

phytophthora palmivora'nın agrobakteri aracılı dönüşümü İçin basitleştirilmiş bir yöntem

A Simplified Method for Agrobacterium-mediated Transformation of Phytophthora palmivora

Phytophthora palmivora'nın Agrobakteri Aracılı Dönüşümü İçin Basitleştirilmiş Bir Yöntem

Phytophthora is an oomycete genus that contains numerous destructive plant pathogens, among which is the broad-host-range species P. palmivora. Functional ...

a-simplified-method-for-agrobacterium-mediated-transformation

Research

JoVE Journal

Biology

Dönüştürmek için basit ve etkili bir...

Moss Verimli Polietilen Glikol (PEG) aracılığı ile Dönüşüm Physcomitrella Dini ayinlerde kullanılan patenler</em

Bu videoda, bir Agrobacterium tumefaciens ikili vektörü kullanarak pirinç genomunun genetik dönüşümünü gösteriyoruz. Bu bakteri, Agrobacterium virülans proteinlerini kullanarak yabancı bir DNA plazmidinin transferini kolaylaştırır.

Agrobakteri Aracılı Genetik Dönüşüm: Genetik Olarak Tasarlanmış Agrobacterium tumefaciens ile Pirinç Genomunu Genetik Olarak Dönüştürmek İçin Bir Yöntem

Bir yüksek verimlilik, otomatik, tütün protoplast üretim ve dönüşüm metodolojisi açıklanmıştır. Robotik sistem dışı bir model ürünlere çevrilebilir olmalıdır modeli BY-2 sistemde güçlü paralel gen ifadesi ve keşif sağlar.

Yüksek verim Protoplast İzolasyonu ve Dönüşüm için Robotik Platformu

Bitki hücreler arası bağlantıları, plasmodesmata (Pd), Fizyoloji ve bitki-virüs etkileşimleri bitki merkezi rol oynarlar. Kritik Pd taşıma olarak proteinler Pd için doğrudan sinyalleri sıralama. Ancak, bu DNA dizileri hakkında bilgimizi henüz emekleme aşamasında olduğunu. Pd yerelleştirme sinyalleri Pd hedeflenmiş proteinler tanımlamak için bir strateji tanımlarlar.

Proteinlerin içinde Planta serilerinde Plasmodesmal yerelleştirme tanımlaması

PBIBAC-GW ikili vektör oluşturma transgenik bitkiler sağlam tek kopya eklemeler, kolay bir süreç ile kolaylaştırır. Burada, bir dizi protokol okuyucu transgenik Arabidopsis bitkiler üretme ve bitkiler intactness için sınama işlemi boyunca rehberlik ve ekleme sayısı kopyalamak sunulur.

Transgenik bitkiler BIBAC-GW ikili vektör kullanarak tek kopya ekleme ile oluşturma

Agrobacterium aracılı dönüşümü daldırma çiçek yöntemini kullanarak başarılı bir şekilde Schrenkiella parvulaextremophyte modelinin kararlı transgenik satırları oluşturmak için istihdam edilebilir. Biz bundan farklı büyüme alışkanlıkları ve extremophyte fizyolojik özellikleri dikkate alınarak Arabidopsis thalianaiçin değiştirilmiş bir iletişim kuralı mevcut.

Bitki büyüme ve Floral daldırma dönüşümün Agrobacterium aracılı Extremophyte Schrenkiella parvula

Burada, iki protokol dönüştürmek patates bitkiler için mevcut. Süre kendi kendine yayılan olabilir bir vahşi türü çekimi transgenik kıllı kökleri Agrobacterium rhizogenes üretmek Agrobacterium tumefaciens dönüşümün tam transjenik bitki için yol açar. Biz o zaman organizatörü etkinlik dönüştürülmüş kökleri boyama GUS tarafından tespit.

Agrobacterium tumefaciens ve Agrobacterium rhizogenes-aracılı dönüştürme, patates ve GUS Staining tarafından Suberin gen organizatörü etkinliği

Bitki morfojenik genler inatçı genotiplerin genetik dönüşümlerini iyileştirmek için kullanılabilir. Burada açıklanan bir Agrobacteriumaracılı genetik dönüşüm (QuickCorn) üç önemli kamu mısır inbred hatları için protokoldür.

Agrobacterium-Rekalsitrant Mısır Inbred Hatları Morfojenik Genler Kullanarak Aracılı Olgunlaşmamış Embriyo Dönüşümü

Çeşitli çalışma alanlarında model bir tür olarak çok yönlü uygulaması nedeniyle, dar yapraklı muzda (Plantago lanceolata) genetik dönüşüm araç setine ihtiyaç vardır.  Burada, Agrobacterium tumefaciens aracılı transformasyon kullanılarak,% 20'lik bir dönüşüm verimliliğine sahip stabil transgenik çizgilerle sonuçlanan bir protokol sunulmuştur.

Agrobacterium tumefaciens-Dar Yapraklı Muzun Aracılı Genetik Transformasyonu

Bu protokol, ilgilenilen gen(ler)i yeşil mikroalgler Chlorella vulgaris'in nükleer genomuna entegre etmek için Agrobacterium tumefaciens aracılı dönüşümün (AMT) kullanımını ana hatlarıyla belirtir ve kararlı dönüştürücülerin üretimine yol açar.

Yeşil Mikroalglerin Agrobacterium tumefaciens Aracılı Genetik Mühendisliği ( Chlorella vulgaris)

Burada, kompozit bitkiler üretmek için Agrobacterium tumefaciens'in aracılık ettiği tek adımlı bir dönüşüm yönteminin ayrıntılı protokolünü sunuyoruz.

Agrobacterium rhizogenes Bazlı Tüylü Kök Dönüşümü ile Kompozit Bitkilerin Üretilmesi İçin Verimli ve Tekrarlanabilir Bir Yöntem

Öğrenin, Phytophthora palmivora ve P. capsici için Agrobacterium aracılı genetik dönüşüm protokolünü. Bu basit ve tekrarlanabilir yöntem, bitki patojenlerinde gen fonksiyonlarını incelemek için değerli bir araçtır.

Phytophthora palmivora'nın Agrobakteri Aracılı Dönüşümü İçin Basitleştirilmiş Bir Yöntem

Daha fazla video keşfet